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No le hace daño.
Si ella realmente cursa con una infección bacteriana, que requiera de antibióticos, no tendrá ningún problema y el antibiótico la hará sentir mejor.
Espero que le hayan hecho exámenes y una radiografía de tórax para poder iniciar le antibiótico, ya que la fiebre es recurrente y sería importante estar seguros del diagnóstico.
Espero haberte ayudado y estaré atento si tienes más dudas para poder orientarte.