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No, no esta descrito que el Fluconazol interfiera con la efectividad de las inyecciones anticonceptivas, así como de ningún método de planificación hormonal ni del condón, por lo cual, puedes consumirlo previa prescripción médica con total normalidad.
Recuerda aplicar tus inyecciones la misma fecha de cada mes, y en casos de error u olvido, cuentan con un margen de error de máximo 3 días, es decir, puede aplicarlas 3 días antes o 3 días después de la fecha que corresponde sin alterar su efectividad.
Ten presente el uso de preservativos, los cuales, además de embarazos, protegen de enfermedades de transmisión sexual.
Espero haber aclarado tu duda, ante cualquier nueva inquietud, estaremos atentos. No olvides calificarnos.