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No, si te refieres a la infección vaginal por Candida Albicans o vaginitis micótica, no afecta la fertilidad, pero si es importante dar tratamiento adecuado cuando es detectada.
Si quedarás en embarazo y estuviera la infección activa, si puede generar complicaciones, como amenaza de aborto o de parto pretérmino, por eso, es importante que informes a tu médico cualquier cambio en tu flujo vaginal en este caso.
Espero sea útil esta información.