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Por lo que refieres, estas presentando alteraciones en el patrón de sangrado, esto suele ocurrir cuando se deja de consumir un método anticonceptivo, en tu caso suspendiste las pastillas a mitad del ciclo, por lo que es más probable que estas alteraciones en el sangrado sean por esa razón. Tu menstruación se normalizará a medida que transcurran más ciclos menstruales.
En cuanto a tu otra duda, si, puede existir un embarazo, ya que mantuviste relaciones sexuales sin ningún tipo de protección, pero esto no podrá confirmarse o descartarse hasta que realices una prueba en embarazo, sugiero que la realices:
Espero haberte orientado, si tienes otras inquietudes no dudes en consultarnos. Gracias por escribirnos. Recuerda calificarnos.