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El tratamiento que relatas es utilizado para algunas de las infecciones vaginales en el embarazo.
En particular el metronidazol se utiliza de forma segura en el segundo y tercer trimestre del embarazo (en el que te encuentras). Adicionalmente es importante tener en cuenta que las infecciones vaginales no tratadas pueden llevar a riesgos como parto prematuro, por lo que es más importante aún hacer el tratamiento indicado.
Por lo anterior, puedes estar tranquila y realizar el tratamiento como te lo envío tú especialista tratante y, en caso de presentar cualquier síntoma de alarma como: aparición de contracciones, sangrado vaginal, salida de líquido abundante por vagina, dolor abdominal o cualquier anormalidad debes acudir a urgencias.