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El dolor bajito con las relaciones sexuales es considerado cómo un signo de alarma por lo que te recomiendo consultar con tu médico de forma prioritaria para que te revise; algunos signos de alarma para consultar de urgencias son: que presentes sangrado vaginal abundante, fiebre, flujo vaginal fétido, náuseas ó vómito persistentes.
Para establecer una causa específica de tus síntomas se requiere de una valoración médica completa que incluya examen físico e historia clínica completos, es posible que incluso requieras estudios adicionales, pero algunas de las causas pueden ser:
Existen medicamentos de venta libre que normalmente sirven para control del dolor y la inflamación, pero que también son usadas para el manejo de hemorragias anormales cómo el naproxeno y el ibuprofeno, sin embargo cada causa específica requiere un manejo específico, por lo que te sugiero consultar, por ahora te recomiendo suspender la actividad sexual y te sugiero el uso constante del preservativo con cada relación sexual.
Espero haber podido ayudarte y orientarte.