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No me queda claro a qué pastillas de la tiroides te refieres, ya que la tiroides puede presentar alteraciones por disminución ó aumento de la función y ambas requieren manejo con medicamentos.
Sin embargo, las pastillas que se usan para el manejo del hipotiroidismo, si deben tomarse en ayunas ya que cuándo hay comida en el estómago la absorción del medicamento puede reducirse en hasta un 30% y esto va a disminuir el efecto.
Por otro lado, debe también tomarse con agua, ya que al tomarla con otro tipo de bebidas la absorción del medicamento también se disminuye.
Espero haber podido ayudarte y orientarte.