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No, a menos que tu dermatólogo así lo haya indicado, no te recomiendo aplicar medicamentos de este de este tipo ya que durante el tratamiento la piel está mucho más sensible y un producto como el peroxido de benzoílo podría resercarte e irritarte más.
No te preocupes ahora por las manchas, lo primero que se espera es controlar el acné y posteriormente, al terminar el tratamiento, tú dermatólogo te indicará el manejo específico para mejorar las manchas o cicatrices que hayan quedado.
No olvides hacer uso del protector solar diariamente mínimo 2 veces al día.
Espero haberte orientado, no olvides calificarnos.