Sí, puedes tomar ambos antibióticos al tiempo.
Es importante aclarar que el Ginkan (metronidazol) indicado por tu médico, cumple función antibacteriana no contra hongos. Esta indicado sobretodo en infecciones vaginales por Trichomonas y vaginosis bacterianas.
Dentro de los efectos secundarios que puede tener el metronidazol son de origen gastrointestinal, por lo que te recomiendo tomarlo después de alguna comida para evitarlos y con abundante agua.
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