Debes empezar el metronidazol cuanto antes y tomarlo de acuerdo a las indicaciones que tu médico te recetó. También es recomendable que comentes esto con tu médico tratante, pues esto podría correr las fechas de tus próximas citas o procedimientos para cuando hayas terminado este último medicamento que apenas vas a empezar.
Lo más probable es que el tratamiento cumpla con su efecto de todas formas a pesar de empezar con este medicamento a la mitad de la toma de los demás, pero aún así es posible que la bacteria H. pylori no pueda ser eliminada del todo. Solamente se podrá confirmar que la bacteria ha sido eliminada cuando hayas terminado de tomar todos tus medicamentos y tu médico te realice otro test.