No, pasados 3 meses no hay ninguna posibilidad de que las pruebas de embarazo fallen, bien sea en sangre u orina, por lo cual, un embarazo en tu caso esta descartado.
Las pruebas de embarazo se encuentran indicadas pasados 10 a 14 días de la última relación sexual de riesgo o pasadas 1 o 2 semanas con retraso menstrual, por lo tanto pasados 3 meses, son totalmente confiables.
Si no deseas concebir en estos momentos, es importante que tengas relaciones sexuales con protección, por lo cual, si no te encuentras bajo una terapia de planificación, te recomiendo acudir a a una valoración médica, para que se te indique la que mejor se ajuste a ti. Ten presente el uso de preservativos, los cuales, además de embarazos, protegen de enfermedades de transmisión sexual.
Espero haber aclarado tu duda, ante cualquier nueva inquietud, estaremos atentos. No olvides calificarnos.