No, el consumo de dichos medicamentos no altera el ciclo menstrual, lo que sí puede hacerlo es un proceso infeccioso activo, por el cual según mencionas, has estado atravesando.
Te recomiendo cumplir con todas las indicaciones dadas para la resolución de la infección y si el retraso persiste, hay que considerar otras causas, entre ellas, un embarazo, por lo cual, si eres sexualmente activa, te sugiero la realización de una prueba de embarazo en sangre, pasadas 1 o 2 semanas con retraso menstrual; en caso de ser descartado, debes acudir a una valoración médica, para realizar los estudios pertinentes, determinar la causa e instaurar el manejo apropiado.
Espero haber aclarado tu duda, ante cualquier nueva inquietud, estaremos atentos. No olvides calificarnos.