Lo que relatas, sugiere efectivamente que cursaron con una faringoamigdalitis, que muy probablemente es de origen viral, por el hecho de que también afectó a tu madre y se acompaña de la congestión nasal, los ojos llorosos y malestar. El vómito café al cual te refieres, bien pudo ser por los alimentos que consumieron y si no se ha presentado de nuevo, pueden estar tranquilos.
Mi recomendación es que en el caso de tu madre, continúe con el manejo analgésico, se hidrate muy bien, evite exponerse a ambientes con mucho polvo o aires acondicionados, un muy buen lavado de manos y si en el transcurso de los próximos días empieza a presentar síntomas como fiebre (temperatura mayor a 38,3 grados) , o vómito con pintas de sangre, dificultad para respirar, alteración del estado de conciencia acudas a un servicio de urgencias.