Es poco probable que se trate de un embarazo, dado que si aplicaste la inyección anticonceptiva en la fecha que correspondía, ibas a estar protegida el día que tuviste relaciones sexuales, además tu pareja no eyaculo en la cavidad vaginal por lo que el riesgo sería aún menor.
La ausencia de menstruación o retraso menstrual puede ser un efecto secundario del método anticonceptivo. Esto no implica ningún riesgo para ti y tampoco quiere decir que el método no este funcionando. Puedes estar tranquila.
Pero, si la idea de un embarazo te genera mucha ansiedad, puedes realizar una prueba de embarazo para que estés mas tranquila.
Espero haber podido resolver tu duda.