Si, porque existen muchos subtipos o sepas del virus del papiloma humano y las vacunas no cubren contra todos. Usualmente cubren entre 2 y 4 subtipos, por esta razón se estima que la vacuna de 4 sepas tiene una efectividad aproximada del 70%.
Aún así la vacuna es muy buena pues las sepas que incluye son las que se asocian con la aparición de verrugas y cáncer, por lo tanto estaras protegida contra las manifestaciones más severas de la enfermedad.