No, no es peligroso esto es totalmente normal, ya que uno de los principales efectos secundarios por la aplicación de implante subdérmico son las irregularidades menstruales, estas suele mejorar luego de varios meses por lo cual no es motivo de retiro del implante.
En caso de persistir por más de 6 meses será necesario que acudas a consulta médica presencial. Recuerda que este método no protege frente al contagio de enfermedades de transmisión sexual, para esto es necesario el uso del preservativo.
Espero haber aclarado tu duda, y que estés más tranquila en caso de alguna otra inquietud estaremos atentos de responder. No olvides calificarnos.