Por lo general la vaginosis bacteriana no presentan ulceras en los genitales, existen otras infecciones que afectan esta zona que si pueden cursar con ulceras, como lo son el herpes y la sífilis (al tener una serología negativa son muy bajas las probabilidades), le aconsejo solicitar cita médica para determinar cual enfermedad es y recibir un tratamiento adecuado.
Adicionalmente le recomiendo siempre hacer uso de condón y evitar tener relaciones sexuales hasta realizar el tratamiento.