Al tener relaciones sexuales, aproximadamente a los 3 días se produce la fecundación del óvulo por el espermatozoide y 7 días después de la fecundación se produce la implantación (el óvulo fecundado se anida en el útero), usualmente el sangrado se produce hacia los días que debe llegar tu periodo, en tu caso sería hacia el 22 de junio por lo que no considero que el manchado sea por implantación.
Si te realizaste una prueba de embarazo a los 25 días de la relación sexual de riesgo y ésta fue negativa, el resultado es confiable dado que, a partir de los 8 días la prueba va a estar positiva en sangre y a los 14 días en orina.
Con respecto a la pastilla del día siguiente, éste medicamento actúa produciendo un espesamiento del moco cervical para que los espermatozoides no puedan fecundar al óvulo pero además interfiere con la ovulación, lo que da lugar a retraso menstrual y sangrados intermenstruales (entre las menstruaciones), si el sangrado que presentas ahora es similar al de tu periodo normal, es probable que sea tu periodo.
Recuerda que la pastilla del día siguiente es un método anticonceptivo de emergencia y no debe ser usado de forma habitual, además te recomiendo el uso constante del preservativo el cual además de protegerte contra un embarazo no deseado, te protege contra enfermedades de transmisión sexual.
Espero haber podido ayudarte y orientarte.