Tu novia no está cursando en éste momento con un embarazo, pues como lo mencionas ella tomó la pastilla de emergencia y después de eso ha tenido su menstruación normal en 3 ocasiones. Por lo que debes tranquilizarte.
Los síntomas que mencionas como dolor abdominal, nauseas, pueden corresponder a síntomas pre-menstruales, tal como tu novia lo refiere.
Sin embargo, te recomiendo, para que no vuelvan a tener éste tipo de sustos, acudan a un centro médico, allí un profesional de la salud los orientará sobre métodos de planificación familiar, sus beneficios y posibles efectos secundarios, ademas les ayudará a encontrar el que mejor se adapte a ustedes.
No olvides que el preservativo es el único método que los protege de infecciones de transmisión sexual.