Puedes estar tranquila, recuerda los principales efectos secundarios del implante subdermico:
1. Irregularidad menstrual tipo retraso menstrual o sangrados intermenstruales
2. Acné
3. Aumento de peso
El principal mecanismo de acción del implante es inhibir la ovulación sin embargo este no detiene la menstruaccion. En tu caso lo mas probable es que tengas un desajuste hormonal secundario al uso del implante, más no por embarazo.
Recuerda que el metodo es muy seguro, aproximadamente del 96% sin embargo como ves ningún método es 100% efectivo por lo cual te recomiendo siempre el uso del preservativo.