Dependiendo de la localización de los parásitos y del tipo de parasitos que se tengan los medicamentos van a variar. Si se sospechan parásitos intestinales, es necesario realizar una prueba de heces que permita diferenciar entre los distintos tipos de helmintos (gusanos) o protozoos (parásitos más pequeños) que esten causando el problema e iniciar el medicamento más adecuado para el organismo.