Es probable que sea por la cicatrización de la herida. Si tomaste el antibiótico ( amoxicilina) de forma puntual y completaste el esquema, no hay razón por la cual tenga que persistir la infección. De ser así habría inflamación local, te estaría doliendo bastante, saldría pus o notarías que hay una región caliente de tu cara. La pasta dental no va a generar mayores daños o entorpecer el proceso de cicatrización y es más higiénico que utilizar solo agua y sal para el lavado de tu boca. Es pertinente si que hagas los buches con agua sal al finalizar para ayudar a limpiar pero puedes lavar el resto de tu boca con crema de dientes sin ningún problema.
Recuerda seguir tus controles de odontología del embarazo y hacerte un chequeo para revisión de este proceso para asegurarnos de que todo salió bien. Como la infección es un factor de riesgo para amenaza de parto pretérmino o aborto, es ideal que si llegas a presentar fiebre, inflamación, enrojecimiento, salida de pus, dolor o ardor al orinar, flujo vaginal que pique, rasque o tenga mal olor, salida de sangre o líquido por la vagina, acudas de inmediato por urgencias para que te atiendan y den manejo inmediato y oportuno.