Entre algunas complicaciones derivadas de la endocarditis infecciosa podemos mencionar la enfermedad de las válvulas cardiacas, absceso intracardiaco, embolismo sistémico, glomerulonefritis y alteraciones neurológicas. Al respecto del aneurisma cerebral roto sus principales complicaciones a largo plazo son las secuelas neurológicas como la parálisis de las extremidades, alteraciones en la sensibilidad, alteraciones en el habla y alteraciones visuales.