Las alteraciones del afecto se relacionan con un desbalance en la disponibilidad o liberación de neurotransmisores, dentro de los cuales se relaciona principalmente un grupo denominado como monoaminas que comprende: noradrenalina, serotonina y dopamina.
Para el caso de la depresión suele existir una disminución en los niveles de noradrenalina y serotonina o una inadecuada regulación de sus vías de transporte y liberación en núcleos cerebrales específicos.