Es posible que se trate de una reacción alérgica tardía a la toma del metronidazol (principio activo del Flagyl) . Por lo que te sugiero acudir a tu médico y suspender el medicamento.
Además del picor corporal puedes presentar como efectos adversos secundarios a la toma del medicamento: dolor de estómago, falta de apetito, náuseas, vómitos, fiebre, malestar general, cansancio, ictericia (piel de coloración amarillenta), orina oscura.
Para aliviar el picor momentáneamente puedes tomar algún antihistaminico de venta libre, o aplicar un gel corporal refrescante. Sin embargo recuerde acudir a su médico.
Espero haber sido de su ayuda, en caso de otra interrogante no dude en consultarnos.