El ejercicio no empeora el acné, a pesar de las connotaciones hormonales que tiene.
De hecho, se ha demostrado que hacer ejercicio puede mejorar los síntomas asociados con el acné. Lo que sí puede empeorar es que una vez finalizado el ejercicio, debes lavarte muy bien la cara porque el sudor sí puede empeorar el acné si no lo limpias.
Lo más importante es NO molestarte los granos, recomiendo que la funda de la almohada o las cobijas siempre estén limpias, realizar limpieza y exfoliación de la piel puede ser con gránulos de azúcar, proteger la piel del sol, usar protección solar, evitar irritantes, no friccionar o presionar la piel, lavarse la cara después de actividades fuertes que le causen algún tipo de sudoración (como en tu caso).
Recuerda continuar con el tratamiento que te recetó el médico y asistir a los controles para evaluar la evolución con el tratamiento.
Espero haberte orientado.