El diagnostico de colon irritable se hace con la clínica y no hay un examen específico ya sea de materia fecal ni de imágenes que pueda hacer el diagnostico correctamente. Es normal tener bacterias aumentadas en materia fecal, que es lo que casi siempre reportan en los laboratorios, porque es normal tener bacterias abundantes en el intestino que son las que se encargan del metabolismo en este órgano, el examen pudo haber sido indicado para descartar una infección intestinal que se diagnostica por la presencia anormal de microorganismos diferentes a bacterias, sangre o presencia de leucocitos, por lo que debe seguir en control con su médico