En el reflujo gastroesofágico el contenido estomacal se devuelve hacia el esófago causando molestias de pirosis o acidez esofágica. El cáncer de esófago, por su lado, tiene muchas causas como por ejemplo fumar, lesiones por virus de papiloma humano u otras. Se puede presentar en algunos pacientes que tienen reflujo gastroesofágico y ese reflujo ha causado cambios visibles de malignidad en la mucosa normal del esófago configurando en ocasiones algo que se conoce como Esófago De Barret. Para diferenciar uno de otro se debe tener en cuenta el comportamiento clínico del paciente y los resultados exploratorios y de biopsia que se hagan de la patología a través de un estudio y seguimiento con endoscopias de vías digestivas.