La Isotretinoína es un fármaco teratogénico, es decir induce la aparición de mutaciones o deformidades a nivel del embrión. Durante su uso se debe mantener un adecuado esquema anticonceptivo, en caso de ocurrir un embarazo se debe suspender de forma inmediata y asistir a valoración médica. La presencia de alteraciones morfológicas importantes o mayores puede facilitar la aparición de pérdidas del embarazo, no necesariamente en etapas tempranas.