¿Si tuve relaciones el 1 y el 31 de diciembre, mi periodo fue el 16 de ese mismo mes, la bebé nació el 3 de octubre con 41 semanas, entonces pudo haber sido concebida el 1? 

La edad gestacional o la edad del embarazo, la calculamos con la fecha de la última menstruación, esta fecha da un "aproximado" de la edad del embarazo, Nunca es exacta. pero haciendo la cuenta regresiva, si la bebé nació el 3 de octubre y los médicos dijeron que tenía 41 semanas, lo más probable es que haya sido concebido en los últimos días de diciembre.